Lando Norris dan Oscar Piastri tampil impresif selama sesi latihan, namun kecepatan yang ditunjukkan oleh Verstappen berhasil mencetak rekor baru dengan waktu 1:26,983 untuk meraih pole position di Suzuka untuk keempat kalinya berturut-turut. Pembalap terkemuka lainnya, Norris, yang saat ini memimpin klasemen, akan memulai balapan dari belakang Verstappen dengan selisih waktu hanya 0,012 detik, sementara pemenang GP Cina, Piastri, akan berada di posisi ketiga berdampingan dengan Charles Leclerc.
Meskipun sebelumnya Mercedes lebih dikhawatirkan karena berhasil menahan duo McLaren, George Russell dan Andrea Kimi Antonelli hanya mampu menempati baris ketiga. Banyak yang memperbincangkan keputusan Red Bull untuk mengganti Liam Lawson dengan Yuki Tsunoda untuk balapan Jepang, namun kedua pembalap tersebut terhenti di sesi kualifikasi Q1.
Lewis Hamilton tampak kecewa karena hanya mampu meraih posisi kedelapan, di depan Williams yang dikendarai Alex Albon dan pembalap Haas, Oliver Bearman. Sesi latihan satu jam ini juga diwarnai dengan kebakaran rumput di pinggir lintasan yang menyebabkan penundaan di Q2, dan setelah insiden tersebut diatasi, banyak perbaikan dilakukan. Akibatnya, Lawson dan Tsunoda harus tersingkir dari sesi kualifikasi.
Hasil kualifikasi F1 GP Jepang juga menunjukkan beberapa pembalap terkemuka seperti Pierre Gasly, Carlos Sainz, Fernando Alonso, dan Esteban Ocon harus puas dengan posisi di belakang grid. Lance Stroll mengalami insiden di Tikungan Dunlop sehingga harus memulai balapan dari belakang. Alhasil, Jack Doohan dari tim Alpine juga terpaksa memulai balapan dari posisi yang jauh setelah mengalami masalah di sesi latihan bebas sebelumnya.
